Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
GferP56213 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
GferP56213 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
GferP56213 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
GferP56213 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GferP56213 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms