Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Faf1P54731 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms