Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PctpP53808 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PctpP53808 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PctpP53808 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PctpP53808 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms