Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Fgd1P52734 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fgd1P52734 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms