Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp10P52479 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp10P52479 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms