Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ClgnP52194 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ClgnP52194 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms