Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn1swP51491 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn1swP51491 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn1swP51491 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn1swP51491 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn1swP51491 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn1swP51491 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms