Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RoraP51448 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RoraP51448 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RoraP51448 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RoraP51448 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms