Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cav1P49817 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cav1P49817 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms