Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HpdP49429 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HpdP49429 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HpdP49429 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HpdP49429 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms