Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnni3P48787 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnni3P48787 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms