Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rfx2P48379 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rfx2P48379 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms