Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VdrP48281 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VdrP48281 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms