Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms