Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rph3aP47708 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3aP47708 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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