Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pax7P47239 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pax7P47239 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms