Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syt1P46096 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syt1P46096 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms