Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ItgavP43406 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgavP43406 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms