Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tlx1P43345 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tlx1P43345 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms