Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gdf5P43027 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gdf5P43027 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms