Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Mmp9P41245 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mmp9P41245 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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