Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VhlP40338 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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