Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3rP40223 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csf3rP40223 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms