Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf2P39429 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Traf2P39429 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Traf2P39429 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms