Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms