Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rom1P32958 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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