Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Saa4P31532 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms