Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc10P31257 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc10P31257 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms