Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PtprmP28828 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprmP28828 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms