Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc6a9P28571 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Slc6a9P28571 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms