Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Etv4P28322 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Etv4P28322 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms