Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ChgaP26339 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ChgaP26339 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms