Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RdxP26043 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RdxP26043 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RdxP26043 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RdxP26043 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RdxP26043 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RdxP26043 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RdxP26043 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms