Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
NdnP25233 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NdnP25233 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NdnP25233 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
NdnP25233 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NdnP25233 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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NdnP25233 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NdnP25233 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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