Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd247P24161 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms