Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms