Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PparaP23204 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PparaP23204 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PparaP23204 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PparaP23204 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms