Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SftpcP21841 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms