Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BdnfP21237 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BdnfP21237 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms