Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tpm3P21107 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms