Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnnc2P20801 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnc2P20801 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms