Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl13aP19253 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms