Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tnnc1P19123 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnnc1P19123 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms