Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rps6ka1P18653 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms