Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtpraP18052 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpraP18052 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms