Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Hoxb1P17919 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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