Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms