Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tgfb3P17125 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms