Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp53P15975 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Usp53P15975 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms