Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rag1P15919 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms